Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms