Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ACTBP60709 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ACTBP60709 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ACTBP60709 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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