Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC1A1P43005 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms