Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGAEP38570 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms