Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA3P32297 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms