Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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