Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRHP20396 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRHP20396 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRHP20396 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRHP20396 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRHP20396 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRHP20396 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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