Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLGNO14967 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms