Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms