Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCDHA12Q9UN75 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms