Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms