Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARFGAP3Q9NP61 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.3 ms