Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM31Q9BZY9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms