Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LGSNQ5TDP6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LGSNQ5TDP6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms