Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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