Protein–RNA interactions for Protein: Q14766

LTBP1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP1Q14766 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LTBP1Q14766 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms