Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms