Protein–RNA interactions for Protein: P36382

GJA5, Gap junction alpha-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA5P36382 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJA5P36382 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA5P36382 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms