Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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