Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-EP13747 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-EP13747 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-EP13747 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms