Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRTO14522 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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