Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXL3Q9UKT7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXL3Q9UKT7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms