Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
OPN4Q9UHM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
OPN4Q9UHM6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms