Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms