Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGNQ9P2M7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGNQ9P2M7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CGNQ9P2M7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms