Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS18Q9P253 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS18Q9P253 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS18Q9P253 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms