Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF275Q9NSD4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF275Q9NSD4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms