Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCNIP2Q9NS61 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNIP2Q9NS61 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms