Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TBC1D23-207ENST00000485687 587 ntTSL 313.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 KLHDC4-221ENST00000568346 343 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-207ENST00000461308 1002 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-216ENST00000555706 583 ntTSL 411.9□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 EVL-222ENST00000557153 590 ntTSL 49.26□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-210ENST00000488688 741 ntTSL 27.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-213ENST00000609263 3101 nt7.35□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 XIAP-204ENST00000430625 528 ntTSL 33.25□□□□□ -1.891e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MGST3-209ENST00000477450 364 ntTSL 32.35□□□□□ -2.031e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 COPZ2-202ENST00000580174 157 ntTSL 32.2□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 ARPP19-210ENST00000567830 275 ntTSL 31.73□□□□□ -2.131e-6■■■■■ 32.9
DROSHAQ9NRR4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.172e-7■■■■■ 32.8
DROSHAQ9NRR4 AC010719.1-201ENST00000602992 747 ntBASIC12.31□□□□□ -0.446e-14■■■■■ 32.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 225.72■■□□□ 1.712e-11■■■■■ 32.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 323.79■■□□□ 1.42e-11■■■■■ 32.8
DROSHAQ9NRR4 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 522.84■■□□□ 1.252e-11■■■■■ 32.8
DROSHAQ9NRR4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.932e-6■■■■■ 32.8
DROSHAQ9NRR4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 322.12■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 220.79■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 315.83■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 315.06■□□□□ 03e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 213.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.512e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 339.09■■■■□ 3.852e-6■■■■■ 32.7
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 225.84■■□□□ 1.733e-17■■■■■ 32.6
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 220.2■□□□□ 0.823e-17■■■■■ 32.6
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-17■■■■■ 32.6
DROSHAQ9NRR4 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC13.22□□□□□ -0.295e-13■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.092e-7■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSPL-202ENST00000310189 1482 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSPL-207ENST00000447745 793 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSPL-208ENST00000486978 609 ntTSL 310.57□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-202ENST00000421758 692 ntTSL 1 (best)19.06■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 DLEU2-206ENST00000449579 791 ntTSL 216.39■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 32.5
DROSHAQ9NRR4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.961e-9■■■■■ 32.4
DROSHAQ9NRR4 SLC22A1-204ENST00000460902 1484 ntTSL 527.27■■□□□ 1.961e-9■■■■■ 32.4
DROSHAQ9NRR4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.951e-9■■■■■ 32.4
DROSHAQ9NRR4 SLC22A1-206ENST00000539263 1598 ntTSL 524.57■■□□□ 1.521e-9■■■■■ 32.4
DROSHAQ9NRR4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.461e-9■■■■■ 32.4
DROSHAQ9NRR4 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC9.93□□□□□ -0.821e-9■■■■■ 32.4
DROSHAQ9NRR4 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 327.91■■■□□ 2.063e-7■■■■■ 32.3
DROSHAQ9NRR4 NFIC-207ENST00000589164 435 ntTSL 319.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 32.3
DROSHAQ9NRR4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 32.2
DROSHAQ9NRR4 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 32.2
DROSHAQ9NRR4 TSC2-211ENST00000467949 590 ntTSL 422.1■■□□□ 1.133e-8■■■■■ 32.2
DROSHAQ9NRR4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.234e-9■■■■■ 32.2
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 32.1
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 32.1
DROSHAQ9NRR4 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 218.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 32.1
DROSHAQ9NRR4 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 533.72■■■□□ 2.991e-6■■■■■ 32.1
DROSHAQ9NRR4 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 228.88■■■□□ 2.217e-7■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.743e-6■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 CC2D1A-204ENST00000587508 1667 ntTSL 530.51■■■□□ 2.483e-6■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.213e-6■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 CC2D1A-203ENST00000586955 2743 ntTSL 1 (best)22.42■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 32
DROSHAQ9NRR4 DENND4A-208ENST00000568515 2655 ntTSL 230.53■■■□□ 2.486e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 DENND4A-206ENST00000564674 3389 ntTSL 1 (best)25■■□□□ 1.596e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 530.69■■■□□ 2.57e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.527e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 534.77■■■■□ 3.164e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 327.82■■■□□ 2.044e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-203ENST00000472664 770 ntTSL 321.98■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-206ENST00000517472 573 ntTSL 33.38□□□□□ -1.874e-7■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)27.01■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)27.01■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)26.06■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 31.9
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-224ENST00000488044 672 ntTSL 424.78■■□□□ 1.566e-7■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-220ENST00000475027 599 ntTSL 519.37■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-210ENST00000454318 581 ntTSL 318.65■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-225ENST00000488979 541 ntTSL 515.95■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-215ENST00000468321 2739 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 31.8
DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-209ENST00000473463 590 ntTSL 230.07■■■□□ 2.41e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-213ENST00000491376 748 ntTSL 430.07■■■□□ 2.41e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-216ENST00000497868 952 ntTSL 525.77■■□□□ 1.721e-6■■■■■ 31.7
DROSHAQ9NRR4 IMPDH1-212ENST00000489263 598 ntTSL 323.33■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 31.7
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