Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC2Q9HBU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC2Q9HBU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC2Q9HBU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms