Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLK4Q9HAZ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLK4Q9HAZ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms