Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDT1Q9H211 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDT1Q9H211 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDT1Q9H211 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 705.9 ms