Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP2Q9C0B6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms