Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRNKL1Q9BZJ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CRNKL1Q9BZJ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRNKL1Q9BZJ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms