Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RSRP1Q9BUV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSRP1Q9BUV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms