Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VGLL1Q99990 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VGLL1Q99990 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VGLL1Q99990 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms