Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTAGE1Q96RT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTAGE1Q96RT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTAGE1Q96RT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms