Protein–RNA interactions for Protein: Q96NX9

DACH2, Dachshund homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DACH2Q96NX9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DACH2Q96NX9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DACH2Q96NX9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DACH2Q96NX9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DACH2Q96NX9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms