Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRELD1Q96HD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRELD1Q96HD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRELD1Q96HD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms