Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZC2HC1AQ96GY0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZC2HC1AQ96GY0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms