Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMIGD2Q96BF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMIGD2Q96BF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms