Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRIM52Q96A61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TRIM52Q96A61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM52Q96A61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM52Q96A61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms