Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASKIN2Q8WXE0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASKIN2Q8WXE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASKIN2Q8WXE0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms