Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HJURPQ8NCD3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HJURPQ8NCD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.2 ms