Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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TMCO5AQ8N6Q1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TMCO5AQ8N6Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TMCO5AQ8N6Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TMCO5AQ8N6Q1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMCO5AQ8N6Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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