Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC33Q8N5R6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC33Q8N5R6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms