Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC46A3Q7Z3Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC46A3Q7Z3Q1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC46A3Q7Z3Q1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC46A3Q7Z3Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms