Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HECW1Q76N89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HECW1Q76N89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
HECW1Q76N89 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms