Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF544Q6NX49 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms