Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFRP4Q6FHJ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFRP4Q6FHJ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFRP4Q6FHJ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms